Putovanje zrakoplovom jamči najbrži put od Manila North Harbor Pier 4, do Zamboanga Port, . Procijenjeno vrijeme putovanja od Manila North Harbor Pier 4, do Zamboanga Port, je 1h 50m. Međutim, imajte na umu da će dolazak do zračne luke, prijava i prolazak sigurnosnih provjera potrajati – bolje je doći u zračnu luku barem sat vremena unaprijed ako letite u zemlji i dva sata unaprijed ako to je međunarodni let.
Trajanje putovanja od Manila North Harbor Pier 4, i Zamboanga Port, je manje-više isto koju god zrakoplovnu tvrtku odabrali za let.